از قرن‌ها پیش از میلاد مسیح در مصر باستان کولون هیدروتراپی به شکل ابتدایی آن انجام می‌شده است. امروزه کولون هیدروتراپی به عنوان یکی از موثرترین روش‌های درمانی مورد استقبال قرار گرفته است. هدف از کولون هیدروتراپی شستشوی روده بزرگ از طریق وارد کردن آب گرم فیلتر شده، از مقعد به درون روده می‌باشد. طی این فرآیند روده از مدفوع، سموم و آلودگی‌های میکروبی پاک‌سازی می‌شود.‌
کولون هیدروتراپی موجب بهبود انقباضات عضلانی یا حرکات دودی روده شده و منجر به بهبود دفع و کاهش جذب سموم می‌گردد. در صورت نیاز به کولونوسکوپی (آندوسکوپی روده بزرگ) رژیم پرهیز غذایی سه روزه معمول می‌تواند با روش هیدروتراپی به کمتر از 12 ساعت کاهش یابد. با استفاده از دستگاه کولون هیدروتراپی Masstec، در مدت زمان بسیار کوتاهی (حداکثر 45 دقیقه) روده کاملاً پاک‌سازی و آماده عمل می‌شود. یبوست مزمن و مقاوم به درمان‌های دارویی به عنوان یکی از ریسک فاکتورهای سرطان روده بزرگ می‌تواند به راحتی و بدون عوارض جانبی توسط هیدروتراپی دوره‌ای درمان یا کنترل شود. همچنین کاهش سموم و آلودگی‌های میکروبی و از طرفی تنظیم فلور طبیعی روده (حضور باکتری‌های مفید/پروبیوتیک) می‌تواند علاوه بر ایجاد احساس راحتی (Well-being) بهبود جذب و فعالیت‌های طبیعی روده و ارگان‌های مجاور (کبد، کلیه و …) را به دنبال داشته باشد.
اگر چه از روش‌های دارویی نیز برای پاک‌سازی روده استفاده می‌شود اما معایبی از جمله زمان بر بودن، تداخلات دارویی و ایجاد اختلالات الکترولیتی در بدن و محدودیت مصرف در خانم‌های باردار و شیرده، بیماران دارای نارسایی کلیه و کبد، سبب شده است کولون هیدروتراپی به عنوان جایگزینی سالم و ایمن معرفی گردد.